С целью усиления советско-финляндской границы в инженерном отношении незадолго перед войной началось строительство Кексгольмского и Сортавальского укрепленных районов, в которых к началу войны были готовы лишь отдельные долговременные сооружения. К созданию полевых оборонительных сооружений на важнейших направлениях войска Ленинградского военного округа должны были приступить лишь летом 1941 г.

В обороне побережья Кольского полуострова и Белого моря наряду с сухопутными войсками должен был участвовать Северный флот с его частями береговой обороны, занимавшими Мурманский укрепленный район и Беломорский укрепленный сектор. Северный флот по своей численности был сравнительно небольшим, состоял в основном из малых кораблей. Флот базировался на Полярное, а также на ряд других пунктов в Мотовском заливе. Тыловая и судостроительная база флота находилась в Архангельске и Молотовске.

Краснознаменный Балтийский флот в 1940 г. получил ряд новых пунктов базирования, выдвинутых к устью Финского залива и на побережье Балтийского моря: Выборг, Таллин, Палдиски, Ханко, Моонзундский архипелаг, Рига, Виндава, Либава.

Резкое расширение операционной зоны Балтийского флота потребовало коренного изменения в системе его базирования. Главная его база была вынесена в Таллин. Кронштадт стал играть роль тыловой базы Балтийского флота.

К началу войны основные силы флота базировались на Таллин, Усть-Двинск (Рига) и Кронштадт. Часть подводных лодок и торпедных катеров базировалась на Либаву и полуостров Ханко.

Выгодное географическое положение островов Эзель, Даго, Осму-сар и полуострова Ханко давало возможность держать под артиллерийским огнем входы в Финский и Рижский заливы: дальнобойной артиллерией с полуострова Ханко и с острова Осму-сар простреливался вход в Финский залив, а батареями с южной оконечности острова Эзель (полуостров Сырве) — вход в Рижский залив (Ирбенский проход).

Крайне неблагоприятным для Краснознаменного Балтийского флота было то, что его коммуникации, от Кронштадта к Таллину и далее на запад, находились под угрозой ударов сил противника из финских шхер, нависавших над нашими сообщениями в Финском заливе. В то же время внутри шхер, расположенных вдоль всего северного побережья Финского залива, имелись глубоководные фарватеры, облегчавшие противнику осуществление скрытого маневра силами, не опасаясь нападения с моря. На участке от бухты Виролахти до полуострова Ханко финны имели ряд сильно укрепленных пунктов, вооруженных дальнобойной артиллерией, которая могла простреливать акваторию Финского залива до его середины. Линия наблюдательных постов, расположенных на побережье и островах Финского залива, а также сеть близлежащих финских аэродромов обеспечивали противнику возможность непрерывного наблюдения за движением наших кораблей по Финскому заливу.

Начало Великой Отечественной войны застало Краснознаменный Балтийский флот в процессе освоения новой операционный зоны. Производилось строительство различных объектов военно-морских баз, аэродромов, оборонительных рубежей и большого количества береговых батарей. Все это строительство к началу войны еще не было закончено.

Черноморский флот Советского Союза перед войной также не имел достаточно благоприятных условий базирования, хотя и располагал рядом оборудованных портов и баз, в том числе такой стратегически важной ключевой позицией, как Крымский полуостров с главной базой флота Севастополем. Кроме главной базы, корабли флота базировались на Одессу, Очаков, Новороссийск и другие порты Черноморского побережья.

Основными недостатками базирования сил Черноморского флота к началу войны были следующие:

• отсутствие заблаговременно организованной обороны военно-морских баз с суши и недостаточность сил и средств ПВО (особенно истребительной авиации) для прикрытия этих баз с воздуха;
• слабость судоремонтной базы на Кавказском побережье;
• слабо развитая аэродромная сеть в восточной части театра военных действий.

Незавершенность подготовки наших западных театров военных действий как сухопутных, так и морских снижала возможности армий прикрытия успешно вести боевые действия по обеспечению сосредоточения и стратегического развертывания войск приграничных военных округов, затрудняла военно-морскому флоту выполнение мероприятий, предусмотренных планами прикрытия, а также отрицательно влияла и на быстроту сосредоточения Вооруженных Сил СССР к западным, границам. Слабо развитая сеть аэродромов в приграничной полосе крайне затруднила боевую деятельность авиации Западного и Прибалтийского Особых военных округов, а также авиации Балтийского флота при действиях последней по прикрытию вынесенных на запад военно-морских баз и опорных пунктов.